1965年新加坡独立后首任总理李光耀要求日本为1942年的“肃清事件”做出战争赔偿，日本一开始拒绝赔偿，后来承认受害者人数约5千人，新加坡政府则认为至少有7万人，双方经过多次会谈，最终日本答应赔款5000万美元，但不附带官方道歉。
1942年日军占领新加坡
1942年2月15日日军占领新加坡，18日开始肃清行动，早在前一年的12月，日军第25军就印发了《海外华人处理指导方针》，将以下几种人列入肃清之列：1，国籍援华机构的人员，2，同情援助中国抗战的新加坡富裕阶层，3，华侨领袖陈嘉庚的追随者，4，海南人，意为祖籍中国海南的移民，5，1937年后，移民新加坡的中国人，6，三合会人员（三合会前身天地会是反清复明组织，编者注），7，加入新加坡义勇军的中国人，由此可见这份文件日军花费了心思，参与计划者包括军人，政治家甚至历史学家，当然还有当时“大名鼎鼎的”大本营参谋辻政信中佐。
陷落后的新加坡
新加坡陷落时有华人约25万，第一批被捕的就达到了5万人，负责审讯的是日军第2战地宪兵队的200名军官和1000名士兵，他们对18-50岁的华人男性逐个筛查，符合上面几点的马上处决，后来扩大了筛查范围，华人妇女儿童如果有反日言论的也会被一样对待，再后来干脆问一个问题：“支持蒋介石还是汪精卫”，回答慢的马上被处决，到最后什么标准都不要了，完全按照日本军官的感觉处决嫌疑人，侥幸过关的人脸上会被盖一个蓝色的印章“审核通过”。
2009年李光耀在接受发采访时回忆道：“当时我很年轻，个子也高，他们逼我下跪，用军靴踹我，我能活下来全靠运气，他们杀了至少7万人，或者9万，我从来都不怀疑那两颗原子弹的必要性，如果没有它们，成千上万的新加坡和马来西亚的华人会被他们杀光”。
二战胜利后英国当局重返新加坡，1947年开始对日本战犯进行审判，但很快遇到了难题，战败前日军已经销毁了所有文件，而且大多数屠杀命令都是通过口头传达的，主犯辻政信中佐因此逃回了日本，然而，还是有亲英美的日本人存在，新加坡日本使馆前任外交官新崎真守站出来指认大屠杀凶手，他的证词让131名日军军官得到了惩罚。
新加坡光复后被俘的日军
回到文章开头的战争赔偿问题，1963年李光耀的首次赔偿要求被日本拒绝，理由是他们已经在1951年与英国政府签订了赔偿协议，那时候新加坡还是英国的殖民地，李光耀反驳：“新加坡的事情只有新加坡人说了算”，1965年新加坡获得完全独立后再次提出赔偿要求，日本政府在国际压力下同意了赔偿（中国政府参与了抵制日货活动），共计向新加坡提供5000万美元的资金，理由却不是大屠杀也不是赔款，而是返还当年在占领区强行发行的国债。
日本发行战时国债
在赔偿问题谈判中，日本总是会提到1951年和英国政府的协议，日本为什么视已经没落的大英帝国马首是瞻，看下面的图或许能了解一二。
上图拍摄于1947年新加坡战犯审判期间，拿着棍子的是英国典狱长弗朗西斯上尉，四名几乎全裸的囚犯全部是日本将军，从左至右，马来亚日军指挥官斋藤少将，强迫战俘修路的宫泽少将，新加坡樟宜的指挥官朝永少将，以及尾形少将，他们在关押期间每当记者参观时，就被要求脱衣拍照。
