印度尼西亞被譽為「萬島之國」，其國土分布在廣大的馬來群島上，擁有17505個島嶼，其中人口最多的是爪哇島，達到1.45億。而面積最大島嶼是加里曼丹島，不過該島不僅僅屬於印尼，島的北半部分還有馬來西亞和汶萊兩個國家，印尼占有該島最多的面積。
造成加里曼丹島「一分為三」的局面，是因為是歐洲殖民者對東南亞勢力範圍的劃分。1950年之前，該島的南北方分別是荷蘭和英國的殖民地。
馬來群島總共兩萬多個島嶼，面積最大的加里曼丹島被三國瓜分
荷蘭殖民地首先在1950年實現獨立，成為現代的印尼。當該島上的英國殖民地準備在1963年獨立時，印尼則希望這些地方連同馬來半島（含新加坡）一起併入印尼。
大印尼主義所涉及的國家
可是，加里曼丹島北方（除汶萊）和馬來半島則不顧印尼的強烈反對，合併為了馬來西亞。馬來西亞和印尼不但為此發生了激烈的武裝衝突，印尼甚至還一度退出了聯合國。
那麼，印尼的這種吞併馬來西亞、新加坡和汶萊的「大國雄心」到底從何而來？
印尼認為自己與馬來西亞合併有充分的理由，除了兩國都分布於馬來群島外，還有他們的主要民族都是由古馬來人演化而來，語言、宗教、文化等方面都非常相似，這是印尼「大國雄心」的基礎。
考古專家們認為，大約在五千年前，開始有古人從亞洲大陸遷移到東南亞半島，再擴散到馬來群島。他們屬於蒙古人種、南島語系，與各個島上的土著融合後，形成了數百個民族，被統稱為「古馬來人」。
馬來群島上生活著兩百多個民族，都是古馬來人的後代
由於南亞次大陸很早就有人來東南亞地區經商和傳播學問，使古馬來人深受到佛教和印度教文化的影響。最先發展起來的古馬來人部落是爪哇人，即現代印尼國家的主要民族爪哇族。
公元前1500年左右，瓜哇人向蘇門答臘島、馬來半島、加里曼丹島等地擴張，他們在馬來群島占有很大的優勢，慢慢形成了一些古國。7世紀開始，爪哇人在蘇門答臘島上建立三佛齊王國，勢力覆蓋整個馬來群島。
三佛齊王國的最大疆域，爪哇島雖然面積不大，但非常肥沃
三佛齊王國崛起後一直與中國保持良好的關係，其國王在唐宋兩代都曾向中國稱臣納貢。隨著海上貿易的發展，東南沿海的華人開始向東南亞及馬來群島移民。
差不多與此同時，阿拉伯商人逐漸來到馬來群島，他們在一些島嶼上興建港口和貿易中轉站，並把伊斯蘭教傳播過來。雖然暫時還沒有打破當地以佛教和印度教為主的宗教格局，但已經開始發生改變。
馬來群島到處留存著佛教和印度教的痕跡，印度文化的影響甚深
14世紀初，三佛齊王國被另一個信奉印度教的爪哇人國家所消滅，佛教勢力受到沉重的打擊。隨著伊斯蘭文明在中亞、西亞地區的強力擴張，及南亞次大陸的衰落，伊斯蘭教終於在15世紀末期超越其他宗教，成為古馬來人的主要宗教。
在阿拉伯商人持續不斷的資助下，古馬來人建立起一系列伊斯蘭蘇丹國，並滅亡了所有非伊斯蘭國家。由於受到島嶼林立的地理限制，伊斯蘭教沒有形成統一國家，而是分裂成眾多的小蘇丹國。
馬六甲的三保井古蹟，據傳是鄭和下西洋時挖掘的
在數百年時間裡，不斷有華人為了逃避戰亂而移民過來，主要居住在馬來半島尤其是半島最南端的馬六甲。宋朝一度在馬六甲設立市舶司，以管理繁忙的海上絲路。1405年開始的鄭和下西洋，帶來了更多的華人移民，主要從事經商和農耕。
16世紀之前，馬來群島和馬來半島上的古馬來人基本上已經皈依伊斯蘭教。他們雖然可以細分出很多民族，但都屬於古馬來人範疇，語言非常接近，爪哇人占到其中約一半的比例。此外還有印度人、華人和阿拉伯人生活在該地區，有一部分人仍保持著自己的民族特性。
1511年，葡萄牙人占領馬六甲，開啟了東南亞地區的殖民時代。歐洲人先挑拔利用各蘇丹國之間的矛盾，再以出兵助戰為誘餌，達到壟斷貿易，甚至扶植傀儡的目標。
16-19世紀，葡萄牙人、荷蘭人、英國人都在爭奪東南亞地區。經過長時間的較量，最弱小的葡萄牙人被趕走，只在馬來群島南部留下一小塊殖民地，即東帝汶的前身。
荷蘭稱霸海洋的時間很短，最重要的殖民地就是荷屬東印度
荷蘭人獲得的殖民地最多，不但奪取了包括蘇門答臘島、爪哇島在內的大部分馬來群島，還侵占了加里曼丹島南半部分。荷蘭人剛到來時，汶萊正處於鼎盛時期，擁有整個加里曼丹島，在荷蘭和英國殖民者的先後打擊下，汶萊很快陷入衰落，國土越來越小。
英國人則先奪取馬來半島，然後從汶萊奪取了北半個加里曼丹島，成立沙撈越和沙巴兩個殖民地。汶萊不僅縮小為一個袖珍國家，最終在1906年徹底淪為英國殖民地。這幾個地方構成了英屬馬來殖民地。
位於吉隆坡的殖民總督府，馬來族和馬來西亞的產生就是殖民時代的產物
英國在18世紀將印度變成自己的殖民地後，開始向東南亞引入大批印度移民，進一步改變了當地的人口比例。而鴉片戰爭以後，清朝對沿海百姓的控制大幅度減弱，更多的華人移民也來到了東南亞。
這些來自印度和中國的移民與當地人融合，一部分堅持自己的信仰和文化習俗，也有不少改信了伊斯蘭教。到20世紀初，英國的馬來殖民地出現了一個新的民族，即信仰伊斯蘭教、以當地古馬來人為主，混有印度和中國血統的馬來族，成為馬來西亞的最主要民族。
由於馬來半島的最南端扼守著馬六甲海峽，戰略地位極其重要，英國人在1867年將此地單獨劃出來，直屬於英國。大批華人遷移過去，華人成為了人口的多數，這塊殖民地後來形成了新加坡。
新加坡位置太重要，英國人有意讓華人占多數，以制衡馬來人
相對於英國殖民地馬來族的混血和多元化，荷蘭殖民地的外來移民很少，保留了更多古馬來人的語言和習俗，血統也更純。但是荷蘭人的殘酷壓榨更甚於英國人，造成了後來印尼的貧困。
總的來看，是歐洲人的殖民統治導致了古馬來人的分裂，英國馬來殖民地的古馬來人自認為是「新的馬來族」，以區分荷蘭殖民統治下的其他馬來民族。事實上，爪哇族與馬來族有著很近的親緣關係，語言也基本相同，這也是印尼「大國雄心」最大的歷史依據。
由於國力弱小，荷蘭在18世紀初退出了海洋霸權的角逐，把殖民重心放在馬來群島上。憑藉強大的海軍，荷蘭人把將近2萬個島嶼整合在一起，統治著包括爪哇族在內的200多個古馬來民族。
荷蘭人長達300年的殘酷剝削，使當地人的反抗從來沒有停歇過。為了緩和矛盾，殖民當局培養很多當地的統治階層去荷蘭接受西方教育。可正是這些留學生從西方學到了民族解放意識，從19世紀末開始，他們用「印度尼西亞」來稱呼打算建立的馬來民族國家。
荷屬東印度曾被稱為香料群島，是荷蘭（少女）脖子上的珍珠
印度尼西亞獨立運動從一開始伴隨著「大印尼主義」，持這種觀點的人認為整個馬來群島和馬來群島只有一個單一民族，語言也相同，應該將荷屬、英屬殖民地統一起來。
到1920年左右，這種思想已經被廣泛傳播，在英屬殖民地也有一定的市場，出現了類似的「泛馬來主義」。這兩個派別還私下討論過獨立後建立單一馬來國家的理念。
在英荷殖民當局的壓制下，獨立運動雖然發展緩慢，但已經被越來越多的人所接受。不幸的是，這股力量被日本法西斯所利用，在太平洋戰爭中站到日本一邊，因為日本答應將英荷殖民地合併為一個國家。
日本人口頭上說解放殖民地，實際卻比西方人更殘暴和貪婪
不過，日本人口惠而不實，僅僅是利用他們趕走歐洲殖民者，不但沒有允許他們建國，反而在1943年把整個馬來群島納入了日本領土。「大印尼主義者」和「泛馬來主義者」只是日本人的擺設，很少有實權。
直到即將戰敗前，日本才開始籌備馬來群島的獨立。日本無條件投降後的第三天，1945年8月17日，大印尼主義者及印尼獨立運動的領袖蘇哈諾等人才趕在歐洲人重返之前，宣布了印尼獨立。
這個倉促成立的印尼自稱包含整個馬來群島和馬來半島，因而遭到英荷兩國的反對，英軍很快占領原來的英屬馬來殖民地，荷軍則對印尼獨立運動發起軍事鎮壓。殘酷的印尼獨立戰爭打了四年，印尼人浴血奮戰終於在1949年11月贏得獨立，蘇加諾出任首位總統。
四年的印尼獨立戰爭很慘烈，死亡人數估計在10萬以上
而英國人在二戰後準備放棄所有殖民地，首先在1948年將馬來半島上的殖民地整合為「馬來亞聯合邦」，並許諾其未來可以獨立建國。新加坡、汶萊和北加里曼丹暫時沒有加入該邦，但也得到了更大的自治權。
此舉對穩定馬來族有非常重要的作用，「泛馬來主義」得不到支持，馬來族得到了看得見的好處，就放棄武裝鬥爭，不再幫助印尼獨立。1957年8月，馬來亞聯合邦宣布獨立，並準備與新加坡、汶萊和北加里曼丹協商成立馬來族國家。這個計劃遭到了印尼總統蘇加諾的強烈反對。
蘇加諾奉行「大印尼主義」，一直在等待時機與英屬殖民地合併成全馬來民族的國家。可英屬殖民地的「泛馬來主義」已經式微，他們自己獨立建國的傾向越來越明顯，並沒有流露出任何與印尼合併的意向。
英國人出於均衡戰略的考慮，自然不希望東南亞地區出現統一的馬來民族國家。允許馬來殖民地獨立既是一種妥協，同時也是一項前提條件，即不能與印尼合併。
