印度尼西亚被誉为“万岛之国”，其国土分布在广大的马来群岛上，拥有17505个岛屿，其中人口最多的是爪哇岛，达到1.45亿。而面积最大岛屿是加里曼丹岛，不过该岛不仅仅属于印尼，岛的北半部分还有马来西亚和文莱两个国家，印尼占有该岛最多的面积。
造成加里曼丹岛“一分为三”的局面，是因为是欧洲殖民者对东南亚势力范围的划分。1950年之前，该岛的南北方分别是荷兰和英国的殖民地。
马来群岛总共两万多个岛屿，面积最大的加里曼丹岛被三国瓜分
荷兰殖民地首先在1950年实现独立，成为现代的印尼。当该岛上的英国殖民地准备在1963年独立时，印尼则希望这些地方连同马来半岛（含新加坡）一起并入印尼。
大印尼主义所涉及的国家
可是，加里曼丹岛北方（除文莱）和马来半岛则不顾印尼的强烈反对，合并为了马来西亚。马来西亚和印尼不但为此发生了激烈的武装冲突，印尼甚至还一度退出了联合国。
那么，印尼的这种吞并马来西亚、新加坡和文莱的“大国雄心”到底从何而来？
印尼认为自己与马来西亚合并有充分的理由，除了两国都分布于马来群岛外，还有他们的主要民族都是由古马来人演化而来，语言、宗教、文化等方面都非常相似，这是印尼“大国雄心”的基础。
考古专家们认为，大约在五千年前，开始有古人从亚洲大陆迁移到东南亚半岛，再扩散到马来群岛。他们属于蒙古人种、南岛语系，与各个岛上的土著融合后，形成了数百个民族，被统称为“古马来人”。
马来群岛上生活着两百多个民族，都是古马来人的后代
由于南亚次大陆很早就有人来东南亚地区经商和传播学问，使古马来人深受到佛教和印度教文化的影响。最先发展起来的古马来人部落是爪哇人，即现代印尼国家的主要民族爪哇族。
公元前1500年左右，瓜哇人向苏门答腊岛、马来半岛、加里曼丹岛等地扩张，他们在马来群岛占有很大的优势，慢慢形成了一些古国。7世纪开始，爪哇人在苏门答腊岛上建立三佛齐王国，势力覆蓋整个马来群岛。
三佛齐王国的最大疆域，爪哇岛虽然面积不大，但非常肥沃
三佛齐王国崛起后一直与中国保持良好的关系，其国王在唐宋两代都曾向中国称臣纳贡。随着海上贸易的发展，东南沿海的华人开始向东南亚及马来群岛移民。
差不多与此同时，阿拉伯商人逐渐来到马来群岛，他们在一些岛屿上兴建港口和贸易中转站，并把伊斯兰教传播过来。虽然暂时还没有打破当地以佛教和印度教为主的宗教格局，但已经开始发生改变。
马来群岛到处留存着佛教和印度教的痕迹，印度文化的影响甚深
14世纪初，三佛齐王国被另一个信奉印度教的爪哇人国家所消灭，佛教势力受到沉重的打击。随着伊斯兰文明在中亚、西亚地区的强力扩张，及南亚次大陆的衰落，伊斯兰教终于在15世纪末期超越其他宗教，成为古马来人的主要宗教。
在阿拉伯商人持续不断的资助下，古马来人建立起一系列伊斯兰苏丹国，并灭亡了所有非伊斯兰国家。由于受到岛屿林立的地理限制，伊斯兰教没有形成统一国家，而是分裂成众多的小苏丹国。
马六甲的三保井古迹，据传是郑和下西洋时挖掘的
在数百年时间里，不断有华人为了逃避战乱而移民过来，主要居住在马来半岛尤其是半岛最南端的马六甲。宋朝一度在马六甲设立市舶司，以管理繁忙的海上丝路。1405年开始的郑和下西洋，带来了更多的华人移民，主要从事经商和农耕。
16世纪之前，马来群岛和马来半岛上的古马来人基本上已经皈依伊斯兰教。他们虽然可以细分出很多民族，但都属于古马来人范畴，语言非常接近，爪哇人占到其中约一半的比例。此外还有印度人、华人和阿拉伯人生活在该地区，有一部分人仍保持着自己的民族特性。
1511年，葡萄牙人占领马六甲，开启了东南亚地区的殖民时代。欧洲人先挑拔利用各苏丹国之间的矛盾，再以出兵助战为诱饵，达到垄断贸易，甚至扶植傀儡的目标。
16-19世纪，葡萄牙人、荷兰人、英国人都在争夺东南亚地区。经过长时间的较量，最弱小的葡萄牙人被赶走，只在马来群岛南部留下一小块殖民地，即东帝汶的前身。
荷兰称霸海洋的时间很短，最重要的殖民地就是荷属东印度
荷兰人获得的殖民地最多，不但夺取了包括苏门答腊岛、爪哇岛在内的大部分马来群岛，还侵占了加里曼丹岛南半部分。荷兰人刚到来时，文莱正处于鼎盛时期，拥有整个加里曼丹岛，在荷兰和英国殖民者的先后打击下，文莱很快陷入衰落，国土越来越小。
英国人则先夺取马来半岛，然后从文莱夺取了北半个加里曼丹岛，成立沙捞越和沙巴两个殖民地。文莱不仅缩小为一个袖珍国家，最终在1906年彻底沦为英国殖民地。这几个地方构成了英属马来殖民地。
位于吉隆坡的殖民总督府，马来族和马来西亚的产生就是殖民时代的产物
英国在18世纪将印度变成自己的殖民地后，开始向东南亚引入大批印度移民，进一步改变了当地的人口比例。而鸦片战争以后，清朝对沿海百姓的控制大幅度减弱，更多的华人移民也来到了东南亚。
这些来自印度和中国的移民与当地人融合，一部分坚持自己的信仰和文化习俗，也有不少改信了伊斯兰教。到20世纪初，英国的马来殖民地出现了一个新的民族，即信仰伊斯兰教、以当地古马来人为主，混有印度和中国血统的马来族，成为马来西亚的最主要民族。
由于马来半岛的最南端扼守着马六甲海峡，战略地位极其重要，英国人在1867年将此地单独划出来，直属于英国。大批华人迁移过去，华人成为了人口的多数，这块殖民地后来形成了新加坡。
新加坡位置太重要，英国人有意让华人占多数，以制衡马来人
相对于英国殖民地马来族的混血和多元化，荷兰殖民地的外来移民很少，保留了更多古马来人的语言和习俗，血统也更纯。但是荷兰人的残酷压榨更甚于英国人，造成了后来印尼的贫困。
总的来看，是欧洲人的殖民统治导致了古马来人的分裂，英国马来殖民地的古马来人自认为是“新的马来族”，以区分荷兰殖民统治下的其他马来民族。事实上，爪哇族与马来族有着很近的亲缘关系，语言也基本相同，这也是印尼“大国雄心”最大的历史依据。
由于国力弱小，荷兰在18世纪初退出了海洋霸权的角逐，把殖民重心放在马来群岛上。凭借强大的海军，荷兰人把将近2万个岛屿整合在一起，统治著包括爪哇族在内的200多个古马来民族。
荷兰人长达300年的残酷剥削，使当地人的反抗从来没有停歇过。为了缓和矛盾，殖民当局培养很多当地的统治阶层去荷兰接受西方教育。可正是这些留学生从西方学到了民族解放意识，从19世纪末开始，他们用“印度尼西亚”来称呼打算建立的马来民族国家。
荷属东印度曾被称为香料群岛，是荷兰（少女）脖子上的珍珠
印度尼西亚独立运动从一开始伴随着“大印尼主义”，持这种观点的人认为整个马来群岛和马来群岛只有一个单一民族，语言也相同，应该将荷属、英属殖民地统一起来。
到1920年左右，这种思想已经被广泛传播，在英属殖民地也有一定的市场，出现了类似的“泛马来主义”。这两个派别还私下讨论过独立后建立单一马来国家的理念。
在英荷殖民当局的压制下，独立运动虽然发展缓慢，但已经被越来越多的人所接受。不幸的是，这股力量被日本法西斯所利用，在太平洋战争中站到日本一边，因为日本答应将英荷殖民地合并为一个国家。
日本人口头上说解放殖民地，实际却比西方人更残暴和贪婪
不过，日本人口惠而不实，仅仅是利用他们赶走欧洲殖民者，不但没有允许他们建国，反而在1943年把整个马来群岛纳入了日本领土。“大印尼主义者”和“泛马来主义者”只是日本人的摆设，很少有实权。
直到即将战败前，日本才开始筹备马来群岛的独立。日本无条件投降后的第三天，1945年8月17日，大印尼主义者及印尼独立运动的领袖苏哈诺等人才赶在欧洲人重返之前，宣布了印尼独立。
这个仓促成立的印尼自称包含整个马来群岛和马来半岛，因而遭到英荷两国的反对，英军很快占领原来的英属马来殖民地，荷军则对印尼独立运动发起军事镇压。残酷的印尼独立战争打了四年，印尼人浴血奋战终于在1949年11月赢得独立，苏加诺出任首位总统。
四年的印尼独立战争很惨烈，死亡人数估计在10万以上
而英国人在二战后准备放弃所有殖民地，首先在1948年将马来半岛上的殖民地整合为“马来亚联合邦”，并许诺其未来可以独立建国。新加坡、文莱和北加里曼丹暂时没有加入该邦，但也得到了更大的自治权。
此举对稳定马来族有非常重要的作用，“泛马来主义”得不到支持，马来族得到了看得见的好处，就放弃武装斗争，不再帮助印尼独立。1957年8月，马来亚联合邦宣布独立，并准备与新加坡、文莱和北加里曼丹协商成立马来族国家。这个计划遭到了印尼总统苏加诺的强烈反对。
苏加诺奉行“大印尼主义”，一直在等待时机与英属殖民地合并成全马来民族的国家。可英属殖民地的“泛马来主义”已经式微，他们自己独立建国的倾向越来越明显，并没有流露出任何与印尼合并的意向。
英国人出于均衡战略的考虑，自然不希望东南亚地区出现统一的马来民族国家。允许马来殖民地独立既是一种妥协，同时也是一项前提条件，即不能与印尼合并。
