儘管新航SQ321班機事故的調查工作仍在進行中，但有報道指出，飛機很可能遭遇了難以預測的晴空亂流，這是亂流等級中最嚴重的。
氣候學者指出科學家通過長期觀測和數據模擬已經發現，極端的晴空亂流事件的發生頻率正在增加。
受訪航空專家表示，亂流其實是相當普遍的情況，空氣的干擾影響飛機的高度、航線和方向。美國一項研究顯示從2009年到2018年，有三分之一所通報的事件涉及亂流。亂流分為四個等級，專家認為新航SQ321班機應該是遇到高強度的晴空亂流情況。
新加坡理工大學航空運輸管理系講師陳晉翰說：「它是一個高度偶發性的一個亂流，基本上它的幾率非常非常的小。很可惜的就是說它已經來不及繞飛，也沒有辦法返航，因為它畢竟從希思羅機場飛了十多個小時，基本上已經沒有航油夠它返航。所以它只能做備降的動作。」
針對有外媒根據氣象分析，認為當時緬甸上空出現一種快速發展的雷暴，導致飛機在毫無預警下遇到晴空亂流，氣候學者指出發展越快速的雷暴在形成之前，晴空亂流會更為強烈。
南大國立教育學院人文與社會學科助理教授、氣候變化研究學者王靖宇博士說：「本次事件發生在印度洋西南季風較為強勁的時期，所以有大量水汽從海洋向陸地輸送，濕潤的空氣會比乾燥的空氣更輕，導致低層大氣有更強的上升趨勢。同時伊洛瓦底流域的地形相對較低，當季風吹進來的時候，地形的抬升作用更為明顯，這兩個作用交疊增加了本地區發生強雷暴快速雷暴和晴空亂流的可能性。」
至於在飛機上遇到這類突發的極端氣流時應該如何應對，專家建議最重要的坐在座位並系好安全帶，用雙手護頭防止上方行李艙的行李落下時被砸傷。如果不在座位上，乘客則應該蹲下握住手柄等來固定自己的位置。
