正值吳冠中先生誕辰100周年之際，長子吳可雨從新加坡來到清華大學，完成了父親這一遺願。吳冠中先生的長子吳可雨於2019年7月1日向清華大學捐贈吳冠中繪畫藝術作品共66件（本），這批作品均為《吳冠中全集》收錄作品，將珍藏於清華大學藝術博物館。
但是關於捐贈，吳冠中一直堅持一個前提，那就是捐贈作品不應該是放在倉庫里的，而應該放在博物館和美術館裡，經常向公眾展出，不僅讓現在的人看，還要讓後人看。所以在吳冠中晚年，他陸續向故宮博物院、中國美術館、上海美術館、香港藝術館、新加坡國立美術館捐贈了大批自己的作品。
吳冠中《荷塘（三）》 1995年 95×180cm 水墨紙本設色
吳冠中 《水鄉》 1997年 45×48cm 水墨紙本設色
吳冠中 《無夢之夜》 1994年 42×54cm 布面油畫
吳冠中 《春雪》 1996年 30×58cm 布面油畫
吳冠中 《安徽水鄉》 2002年 40×44cm 水墨紙本設色
吳冠中 《農家小院》 2002年 46×61cm 布面油畫
吳冠中《竹林》2005年 48×45cm 水墨紙本設色
吳冠中《海港晨曦》 2006年 45×60cm 水墨紙本設色
《長江萬里圖》2008年上拍，所得款項捐贈給清華大學教育基金會並設立「吳冠中藝術與科學創新獎勵基金」
2008年，吳冠中拍賣了《長江萬里圖》作品，將全部所得款項（1275.75萬港元）捐贈給清華大學教育基金會並設立了「吳冠中藝術與科學創新獎勵基金」，寄望以此助推有志於藝術與科學融合創新的青年人才脫穎而出。為研究、傳播吳冠中藝術與藝術教育思想，清華大學於2010年專門設立了吳冠中藝術研究中心。
2010年8月29日，吳冠中逝世兩個月後，正值其91歲誕辰之際，以其名命名的「吳冠中藝術研究中心」在清華大學成立。吳可雨擔任中心執行主任，並向清華大學捐贈了乃父水墨作品《春酣》。文化部副部長王文章擔任該中心名譽主任，吳冠中高足劉巨德擔任中心主任，首批近200名研究吳冠中藝術的國內外專家獲得了研究員聘書。
吳先生一生致力於中國藝術的探索與創新，他提出的「風箏不斷線」的理念，將具象與抽象兩種繪畫形態融為一體，創造出中西結合、雅俗共賞的意象世界，使中國傳統藝術的精神得以弘揚光大，將油畫民族化和中國畫現代化推向了新的境界。吳冠中先生對學生充滿愛心，他一直鼓勵年輕人要有創新的想像，從而啟迪了一批青年人的藝術生涯以及後來的成長。
吳冠中重點捐贈歷程：
1、1999年、2009年 中國美術館 62幅；
2、2006年 故宮博物院 3件；
3、2005年，2007年，2009年 上海美術館87件；
4、2008年 新加坡國家美術館113件；
5、2009年 浙江美術館72幅；
6、1995、2002、2018 香港藝術館450件；
7、2019年 清華大學藝術博物館66件
