鑒於新加坡近來社區病例激增，教育部制定額外防疫措施，將為小學和特需學校採取額外防疫措施，以更好地保護還無法接種冠病疫苗的孩童。
按照考試安排，今年9月30日至10月6日期間舉行小六會考。
居家學習
與2020年年終國考安排類似，小六學生將於2021年9月25日至29日在小六會前進行休學，以儘量減少校內傳播的風險，減少人數在考試前被隔離(QO)或請假(LOA)的學生。
考慮到近日不能接種疫苗的學生受到疫情影響激增，教育部還提出新的安排，在今年小六會考期間，為所有小一至小五學生實施居家學習（HBL），即從2021年9月27日至小六結束（2021年10月6日）。
居家學習期間，小學和特需學校將繼續為需要額外幫助的學生提供幫助。
教育部幼兒園、幼兒園託管服務（KCare）和學生託管中心將如常運作。家長若無法在家辦公或做出其他託管安排，可向孩子的學校尋求協助。
返校前自測
教育部也鼓勵小學生在在以下日期在家中自行做抗原快速檢測（ART）。這將提供足夠的時間間隔，如有必要，讓學生進一步接受聚合酶鏈式反應（PCR）檢測。
小六：2021年9月27日或28日
小一至小五：2021年10月4日或5日
到了下周一（9月20日），本地約九成的家庭應該都會收到抗原快速檢測儀，學校也在派發檢測儀給學生與教職員，讓人們在家自行檢測。
衛生部醫藥服務總監麥錫威副教授說，民眾如果在無症狀的情況下，自行檢測後發現結果呈陽，應該在家裡隔離至少72小時，然後再做一次檢測，確保呈陰後才恢復日常活動。
考場措施
對所有考生進行體溫測量和檢查。
在考試期間始終佩戴外科口罩或具有同等效果的可重複使用的口罩。
對於在學校禮堂進行的考試，將進行區域劃分，每個區域最多有50名考生，每個場地最多有250名考生。各區之間至少要有3米的間隔。在每個區域內，考生的座位相距至少1.5米。
對於在教室進行的考試，每間教室最多有30名考生，他們的座位相距至少1.5米。
錯開考生離開的時間，以及隔離進入和離開的路線，以儘量減少考生的混雜，避免擁擠。
小六會考改革
小六會考今年改以「八級」的積分等級來評估學生自身學習表現，不再採用與同屆考生相比較後計算的T值積分。各科等級積分加起來的總成績，類似Ｏ水準會考升學使用的積分計算法。
小六考生每科的積分等級介於AL1至AL8，AL1為最優秀的。學生在小六會考四科總成績因此會介於4分至32分。
新加坡教育部指出，新制度不對成績做過於細緻的區分，較多學校會有相同的截分點，學生能有更廣的選擇。
整體而言，各中學的截分點介於6分至30分，沒有學校出現4分的截分點。但教育部認為基於積分制的設計等原因，接下來不太可能有學校出現4分的截分點，每屆截分點的波動一般僅有一分之差。
N水準聽力考試問題
9月13日，參與N水準英語聽力考試的學生對於低沉的配樂和強烈的口音表示不滿。
超過1,400人在Change.org請願網站上簽署了一份請願書，要求重新進行考試。
新加坡考試與評估委員會(SEAB)表示，已收到反饋，但是並沒有重新安排考試的計劃。
SEAB指出，廣播音頻可能受到「環境因素的影響，如下雨、道路施工和轉動風扇」，因為作為安全管理措施的一部分，學校被建議保持教室窗戶打開和風扇開啟。
對於口音的問題，SEAB表示，今年考試的文本閱讀者是新加坡人，他們講的是國際上可接受的英語，並且在過去幾年的國考中都有過表現。
「將使用不同的語音質量，如節奏、音量和語調，以確保音頻文本的真實性。
「此外，各個國家聽力理解考試的音頻文本中使用的單詞對於考生的預期水平來說是可以理解的。」
